蛋白质、糖蛋白、脂蛋白、酶类、补体、脂多糖、细菌外毒素和核酸等均为可溶性抗原，它们有相当部分来源于组织和细胞，成分复杂。制备这类免疫原时，首先须将组织和细胞破碎，然后再从组织和细胞匀浆中提取目的蛋白或其他抗原，提纯的抗原需鉴定后才能用做免疫原。
为获得好的免疫效果，抗原纯化后应进行鉴定才能用于动物免疫，抗原的鉴定主要包括以下几个方面：
1、含量检测
蛋白含量的测定最准确的方法是凯氏定氮法，但由于要求有精密设备，故不适合一般实验室。一般实验室均采用分光光度计测量法。该法首先测定280nm和260nm的吸光度（A），再用经验公式计算蛋白含量。
蛋白含量（mg/ml）=A280×1.45-A260×0.74。
另外蛋白含量也可采用福林酚法，具体操作见临床生化技术。
2、分子量的鉴定
测定分子量一般采用SDS-PAGE电泳法，详见临床生化技术。
3、纯度鉴定
常采用区带电泳法鉴定，详见临床生化技术。
4、免疫活性鉴定
常采用双向琼脂扩散试验。
